
Администрация
Руководителем Зоологического института является директор. Он осуществляет руководство институтом на принципах единоначалия, организует работу института в пределах своей компетенции и несет ответственность за его деятельность. В настоящее время директором Зоологического института является член-корреспондент РАН Никита Севирович Чернецов (Приказ Минобрнауки России № 20-3/720 п-о от 24 декабря 2019 г.).
В целях сохранения преемственности и обеспечения развития научных школ и направлений в Зоологическом институте введена должность научного руководителя. Научным руководителем института является академик Олег Николаевич Пугачев, директор Зоологического института в 2006-2018 гг.
Директор Зоологического института имеет двух заместителей по научной работе. Заместителями директора являются д.б.н. Сергей Юрьевич Синев и к.б.н. Игорь Геннадьевич Данилов. Заместителем директора института также является директор Биологической станции «Рыбачий» к.б.н. Андрей Леонидович Мухин. Кроме того, у директора института есть заместитель по музейной работе. Эту должность занимает Милена Николаевна Третьякова. Заместителем директора по общим вопросам является Юрий Анатольевич Григорьев; в его обязанности входит административное и техническое обеспечение работы института.
В институте предусмотрена должность ученого секретаря; его должностные обязанности определяются директором института. Ученым секретарем Зоологического института является к.б.н. Наталья Николаевна Безбородкина.

Чернецов
Никита Севирович
Директор

Пугачёв
Олег Николаевич
Научный руководитель института

Синев
Сергей Юрьевич
Заместитель директора по научной работе

Данилов
Игорь Геннадьевич
Заместитель директора по научной работе

Мухин
Андрей Леонидович
Директор филиала, заместитель директора

Третьякова
Милена Николаевна
Заместитель директора по музейной работе

Григорьев
Юрий Анатольевич
Заместитель директора по общим вопросам

Безбородкина
Наталья Николаевна
Ученый секретарь