ПРОТИСТЫ
ЭЛЕКТРОННАЯ КОЛЛЕКЦИЯ
 
о


зачем она нужна?       из чего строим?      когда будет?

КРАТКОЕ СОДЕРЖАНИЕ ПРОЕКТА
ЭЛЕКТРОННАЯ КОЛЛЕКЦИЯ <ПРОТИСТЫ>.

Проект предполагает создание электронной коллекции, которая объединит три  депозитария протистов, размещающихся в Зоологическом институте РАН, Институте цитологии РАН и в Санкт-Петербургском Государственном университете, а также банки живых культур протистов. На Web-сервере Зоологического института РАН размещены домашняя страница и гипертекстовый каталог электронной коллекции, снабженный формами для контекстного поиска и формирования электронных запросов. Каталог дополнен краткими описаниями образцов с указанием их индекса в электронной коллекции. Переход к описаниям осуществляется по гипертекстовым ссылкам. В период разработки и наполнения данными электронная коллекция <ПРОТИСТЫ> размещается на дисковом носителе коллекционного сервера лаборатории протозоологии ЗИН РАН. Для создания коллекции используется среда разработки авторских гипермедиа приложений Hypermethod v. 3.0. Полная версия коллекции <ПРОТИСТЫ> будет включать “Каталог” (идентичный, представленному в Интернете) и гипермедийную “Коллекцию”, каждый кадр которой будет содержать оцифрованное изображение препарата (видио для культур и сложных трехмерных объектов) и гипертекстовый документ с их описанием. Информационно поисковая система коллекции будет работать по контекстному и индексированному поиску и SQL запросам. Пользователь, найдя в Интернет-каталоге интересующий его вид (род и т.д.) протистов, непосредственно с этой страницы сможет послать E-mail запрос на коллекционный сервер и получить полную информацию об интересующем объекте, включая его изображение. Полная версия электронной коллекции <ПРОТИСТЫ> будет размещена в 2002 году на дисковых носителях у участников проекта и передана в РФФИ на CD ROM .

ЗАЧЕМ НУЖНА ЭЛЕКТРОННАЯ КОЛЛЕКЦИЯ ПРОТИСТОВ?

Решение многих фундаментальных проблем современной биологии немыслимо без исследования протистов, уникально сочетающих в себе черты отдельной клетки и целостного организма. Помимо классических фундаментальных исследований систематики, филогении и биоразнообразия животного мира протисты широко используются в качестве модельных объектов при изучении механизмов клеточной дифференцировки и эволюции генома, без их изучения невозможен анализ функционирования пищевых цепей в различных экосистемах. Протисты очень большая и разнообразная группа живых организмов, работа с которыми требует постоянного обращения к коллекционным материалам. На определенном этапе исследований с этой проблемой сталкивается любой ученый независимо от своей специализации. Коллекции протистов созданы и развиваются во всех крупных научных центрах по всему миру. Однако обращение к этим коллекциям крайне затруднено. Объединив в “Электронную коллекцию” крупнейшие в России депозитарии протистов и банки их живых культур, мы откроем к ним доступ всем исследователям, работающим над решением фундаментальных проблем современной биологии. Предполагаемый круг пользователей “Коллекции” - это зоологи, экологи, клеточные биологи, медики, ветеринары, студенты и преподаватели вузов.

 в начало

ТЕХНИЧЕСКАЯ СТОРОНА ВОПРОСА.

Обращение удаленных пользователей к Интернет-каталогу коллекции протистов осуществляутся с использованием стандартных броузеров типа Netscape Navigator или Microsoft Explorer. Рекомендуемое разрешение монитора 1024х 768. Интернет документы коллекции размещаются на Web сервере Зоологического института РАН www.zin.ru Пользовательский интерфейс каталога выполнен в виде гипертекстового документа, снабженного формами для  поиска и отправки E-mail запросов в интерактивном режиме. Создаваемая электронная коллекция протистов, размещается на коллекционном сервере лаборатории протозоологии РАН, на машине PII 128 Mb RAM, 10 Gb Hdd, 32 Mb ASUS AGP-V3800/TVR video, Windows 98, укомплектованной средствами мультимедиа, системами ввода и обработки и хранения изображений (Philips CD RW, Panasonic CCTV camera WV-CP650/G). Разработка коллекции осуществляется в среде HyperMethod v.v. 2.5-3.0. Среда разработки авторских гипермедиа приложений HyperMethod представляет разработчику следующие функции: создание гипертекстов с практически неограниченным числом перекрестных ссылок, WYSIWYG редактирование, Drag-and-drop редактирование и HIS редактирование, поддерживается технология Active X. Система поиска информации в конечном продукте предполагает сквозной поиск по контекстным, индексированным и SQL запросам. Среда поддерживает следующие интересующие форматы: для текстов: Text TXT, RTF, HTML, для графики и видео: GIF, BMP, JPG, WMF, MPEG, MOV, AVI. Объекты приложения находятся под управлением скриптов (язык HM Script), предоставляющих пользователю более 100 функций и процедур. Интерфейс конечного продукта представлен в виде HM проигрывателя с названием коллекции, работающего в интерактивном режиме и наделенного функциями поиска, просмотра, передачи и сохранения информации. Коллекция представлена набором кадров (рамок). Каждая рамка включает гипертекстовый документ и графические или мультимедиа вставки. Кадры связаны друг с другом и с поисковыми системами перечисленными выше типами перекрестных ссылок. Для просмотра видео конфигурация операционной системы должна включать Windows Media Player. Связь участников проекта с коллекционным сервером для передачи данных осуществляться через систему удаленного доступа по коммутируемым линиям. Предполагаемый объем полной версии коллекции 2.5 Gb.

 в начало

СРОКИ РЕАЛИЗАЦИИ ПРОЕКТА

1. Январь-декабрь 2000: разработка и размещение на Web-сервере ЗИН РАН домашней страницы и гипертекстового каталога коллекции

2. Январь-декабрь 2001: размещение на коллекционном сервере ЗИН РАН электронной коллекции протистов и ее наполнение с компьютеров участников проекта

3.Январь-декабрь 2002: завершение наполнения электронной коллекции с удаленных компьютеров, отладка и оптимизация всех типов внутренних связей, размещение готового продукта на PC участников проекта, снятие ограничений по работе с запросами от удаленных пользователей.
  в начало