Долгое время все живые организмы разделялись на два царства "Животные" и "Растения". Сейчас стало ясно, что необходимо выделять значительно большее число царств, но вопрос об оптимальном их числе пока не может считаться решенным и остается одной из спорных проблем макросистемы живого. Наиболее удачным для практических целей на наш взгляд является выделение пяти больших групп организмов, условно названных царствами - (так, как это наглядно изображено на заглавной странице проекта).
Точные границы между этими царствами провести невозможно, но прокариоты (или бактерии) отличаются от остальных живых организмов (эукариот) достаточно четко - отсутствием в клетках ограниченного мембраной ядра. Иногда прокариот считают надцарством, состоящим из нескольких царств.
В последние годы интенсивно разрабатывается филогенетическая система организмов, основанная на сравнении нуклеотидных последовательностей рибосомальных рибонуклеиновых кислот. Согласно этой системе две группы прокариот - бактерии и археи - имеют равный с эукариотами ранг надцарства (Domain). Филогенетическая классификация бактерий и архей положена в основу 2-го издания "Руководства по систематике бактерий Берги".
На Веб-странице Всероссийской коллекции культур микроорганизмов (ВКМ) представлена информация о более чем 20 тыс. штаммов микроорганизмов, поддерживаемых в российских коллекциях культур.
